Share This
Связаться со мной
Крути в низ
Categories
//Необычная структура генома одного из видов планктона удивила учёных

Необычная структура генома одного из видов планктона удивила учёных

01.05.2021Category : My Habr

neobychnaja struktura genoma odnogo iz vidov planktona udivila uchjonyh f5dc8c9 - Необычная структура генома одного из видов планктона удивила учёных

У одноклеточного планктона из группы динофлагеллятов оказался очень необычно организованный геном. Результаты научной работы, в которой принимали участие учёные из Саудовской Аравии, США и Германии, расширяет наше представление о том, как может выглядеть геном эукариотов.

Исследователи изучали строение генома кораллового симбионта Symbiodinium microadriaticum. Этот геном уже был секвенирован и собран в сегменты, т.н. скаффолды, но на уровне хромосом сборка ещё не проводилась.

Учёные использовали технику Hi-C, чтобы определить взаимодействие частей хроматина – комбинации ДНК и белков, составляющих хромосом. Таким образом они хотели понять, как скаффолды соединялись в хромосомы (определить их конформацию) как в пространственном, так и в структурном смысле.

Неожиданно оказалось, что гены планктона организовывались в виде перемежающихся однонаправленных блоков. По словам Октавио Салазара, постдока из Научно-технологический университета имени короля Абдаллы, одного из ведущих авторов исследования, такая структура кардинально отличается от всего, что можно наблюдать у других организмов. Обычно гены в хромосоме выстраиваются случайным образом. В данном же случае они были строго ориентированы то в одну, то в другую сторону, перемежаясь друг с другом, и границы блоков были чётко видны в данных по взаимодействию хроматинов.

Такая организация генома сказалась и на его трёхмерной структуре. Также интересно, что она, судя по всему, от транскрипционной активности. Когда исследователи обработали клетки химическим веществом, блокирующим транскрипцию генов, характерные структурные блоки исчезли.

Это, по-видимому, связано с тем фактом, что у данного планктона очень мало факторов, влияющих на транскрипцию, и они не реагируют на изменение окружающей среды изменением экспрессии генов. Пока непонятно, адаптируются ли они при помощи утери или приобретения хромосом, или при помощи эпигенетических модификаций структуры – учёные планируют выяснить это в дальнейшем.

Также неясно, откуда взялась такая необычная структура генома. Динофлагелляты используют очень мало гистонов, а вместо них применяют давно вошедшие в свой геном вирусные белки. Предстоит выяснить, есть ли связь между этими фактами.

Исследование показывает, что иногда ожидания и разные догмы, выработанные на основе изучения других эукариотов, дают сбой. Природа может работать совершенно не так, как предполагали учёные, и во время эволюции могло реализоваться очень много разных возможностей.

  • 0 views
  • 0 Comment

Leave a Reply

Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *

Этот сайт использует Akismet для борьбы со спамом. Узнайте, как обрабатываются ваши данные комментариев.

Свежие комментарии

    Рубрики

    About Author 01.

    Roman Spiridonov
    Roman Spiridonov

    Привет ! Мне 38 лет, я работаю в области информационных технологий более 4 лет. Тут собрано самое интересное.

    Our Instagram 04.

    Categories 05.

    © Speccy 2020 / All rights reserved

    Связаться со мной
    Close