Share This
Связаться со мной
Крути в низ
Categories
//Биологи полностью расшифровали геном енотовидной собаки

Биологи полностью расшифровали геном енотовидной собаки

16.05.2021Category : My Habr

Исследователи из Политехнического университета Валенсии и Университета страны басков смогли аннотировать полный геном енотовидной собаки. Известно, что этот вид является переносчиком многих заболеваний, которые могут поражать человека, включая Covid-19.

biologi polnostju rasshifrovali genom enotovidnoj sobaki 828220d - Биологи полностью расшифровали геном енотовидной собаки

Енотовидные собаки (Nyctereutes procyonoides), близкие родственники лисы (Vulpes vulpes) произошли из Восточной Азии, а в 1940-х годах были завезены в Европу. Хотя самые южные популяции, обнаруженные на данный момент, находятся во Франции, исследования предсказывают, что животные могут поселиться на Пиренейском полуострове в течение следующих 20 лет. Это имеет большое значение с точки зрения общественного здравоохранения, поскольку, как известно, енотовидная собака является переносчиком множества заболеваний, которые могут поражать людей, включая коронавирус.

Для расшифровки генома использовались долгое секвенирование третьего поколения (PacBio и Oxford Nanopore Technologies) и методы биоинформатики. Основная проблема заключалась в сложной хромосомной структуре вида, которая характеризуется наличием необычно больших теломер и центромер, а также различного количества хромосом B-типа. Все эти элементы характеризуются некодирующими повторяющимися участками ДНК, которые очень трудно секвенировать и впоследствии изучать.

Размер полученного генома составляет 2,39 гигабаз, в нем идентифицировано и аннотировано более 27 тысяч генов. Кроме того, 39 % собранного генома состоит из повторяющихся областей.

biologi polnostju rasshifrovali genom enotovidnoj sobaki 7072f84 - Биологи полностью расшифровали геном енотовидной собаки

b) Естественный (оранжевый) и нынешний и прогнозируемый (фиолетовый) ареалы обитания енотовидной собаки. c) Рабочий процесс сборки и аннотации генома. d) График, показывающий глубину охвата генома считыванием, GC-состав и размер охвата. e) Синтения генома, полученная с помощью инструмента визуализации Jupiterplot.

Несмотря на то, что енотовидные собаки на 12 млн лет «моложе» волков, выяснилось, что у обоих видов существует сходство между структурой и составом геномов.

Данная работа послужит для будущих исследований, которые включают ассоциацию генов с болезнями, изучение архитектуры хромосом, а также для работ по теории эволюции.

  • 0 views
  • 0 Comment

Leave a Reply

Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *

Этот сайт использует Akismet для борьбы со спамом. Узнайте, как обрабатываются ваши данные комментариев.

Свежие комментарии

    Рубрики

    About Author 01.

    Roman Spiridonov
    Roman Spiridonov

    Привет ! Мне 38 лет, я работаю в области информационных технологий более 4 лет. Тут собрано самое интересное.

    Our Instagram 04.

    Categories 05.

    © Speccy 2020 / All rights reserved

    Связаться со мной
    Close